通用氣相色譜儀的氣路系統由載氣源、壓力調節器、穩壓閥、針形閥、轉子流量計、柱子及連接管路組成。氣路系統的泄漏故障，是氣相色譜儀常見的故障之一，會嚴重影響色譜儀的正常使用。由于泄漏點位置和泄漏程度的不同，通用氣相色譜儀氣路泄漏具體表現為以下幾種現象：
基線無規則微小波動，影響小體積分數的檢測；
基線漂移；
基線噪聲、漂移。
靈敏度降低、檢測器檢測到的組分的出峰峰面積減小、峰高降低，而且還增加氣源的額外消耗。因此必須經常檢查氣路是否泄漏。
對氣路的粗略觀察，通常在氣源打開并穩定后，不應聽到氣路流經的各管路及閥件接頭處有“絲絲”的跑氣聲。如聽到明顯的漏氣聲，或者使用中發現鋼瓶一次壓力下降較快，則儀器必存在大漏，必須立即查出漏點并加以排除。氣路的嚴重泄漏也可以在流路的流量大時，用檢漏液在各接頭逐點測試(有氣泡出現)而加以證實。若檢漏液沒有反應，可使用膠皮管，一端貼著耳朵，一端放在接頭上，如聽到咝咝聲，則表明接頭漏氣。
對氣路中輕微漏氣的檢查方法是用硅橡膠或封口塞堵住氣路出口,增加柱前壓力至300-400kPa，這時流量計應無指示；若有指示，則表示氣路漏氣，可以將從氣源出發的管路逐段封住，逐段檢查。
通用氣相色譜儀在重新連接管路之后,應進行儀器氣路系統密封性的檢查。方法是堵住氣路出口，充入足夠高壓力的載氣，幾分鐘后關閉載氣，觀察壓力表是否在15min之內下降。此時如果色譜儀主機裝有載氣截止閥，則可以分別進行主機內部管路和主機到氣源鋼瓶之間的外部管路的漏氣檢查。若氣路出口打開，而轉子流量計卻沒有指示，則表示該氣路存在堵塞的現象，同樣可以分段檢查,查到堵塞處、將其通開。
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